使用的软件:VASP, VESTA, SshClient Definition 差分电荷密度 (deformation charge density) : 成键后的电荷密度与对应的点的原子电荷密度之差。通过差分电荷密度的计算和分析,可以清楚地得到在成键和成键电子耦合过程中的电荷移动以及成键极化方向等性质。 二次差分电荷密度 (difference charge density) :指同一个体系化学成分或者几何构型改变之后电荷的重新分布。 一 差分电荷密度计算 Charge density difference of system AB: ∆ρ = ρAB − ρA − ρB NOTE: AB, A, B 需放在相同大小的空间格子。 In calculation of the latter two quantities, the atomic positions are fixed as those they have in the AB system. Some NGX NGY NGZ 结构优化后 的自洽计算 mkdir AB mkdir A mkdir B INCAR file SYSTEM=X ISTART=0 ENCUT=350 EDIFF=1E-5 IBRION=-1 POTIM=0.25 NSW=0 # Only electronic-SC loops are performed EDIFFG=-1E-2 ISMEAR=0 SIGMA=0.05 PREC=ACCURATE ISIF=2 NPAR=4 #LWAVE=FALSE #LCHARG=FALSE # CHGCAR is written LREAL=Auto #IALGO=48 ISYM=0 NGX=x # 增加 NGY=y # 增加 NGZ=z # 增加 NGZ NGY NGZ 的获取:在结构优化的 OUTCAR 文件中搜索,设置环境变量后输入 ngx 获得 vi ~/.bashrc alias ngx="grep -A3 'NGX' OUTCAR" source ~/.bashrc POSCAR file cp opt/CONTCAR POSCAR A, B 各自保留优化后的 POSCAR
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