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VASP的电荷密度计算及图像处理


使用的软件:VASP, VESTA, EidtPlus,SshClient

一 电荷密度计算

在能带计算完成基础下,拷贝 band 文件夹为 charge
cp -rf band charge
编辑 charge 下文件

INCAR

SYSTEM=x # x 为注释名
#ISTART=1 # 修改
#ICHARG=1 # 修改
#LORBIT=11 # 修改
ENCUT=350
EDIFF=1E-5
IBRION=2
#POTIM=0.25 # 修改
NSW=0
EDIFFG=-1E-2
ISMEAR=0
SIGMA=0.05
PREC=ACCURATE
ISIF=2
NPAR=4
LWAVE=FALSE
#LCHARG=FALSE
LREAL=Auto
#IALGO=48
ISYM=0
LPARD=.TRUE. # 增加,注意打点
IBAND=xxx yyy # 价带顶和导带底所在行数
#KPUSE=1 2 3 4 # 增加
LSEPB=.TRUE. # 增加
LSEPK=.FALSE. # 增加
提交作业,作业完成后,得 PARCHG.0xxx.ALLK 和 PARCHG.0yyy.ALLK 文件,使用软件 SshClient 将文件导出至计算机。

二 图像处理

  1. 将 PARCHG.0xxx.ALLK 和 PARCHG.0yyy.ALLK 文件重命名为 得 PARCHG.0xxx.ALLK.vasp 和 PARCHG.0yyy.ALLK.vasp,在软件 VESTA 中打开。
  2. 简单编辑:Edit \rightarrow Bonds \rightarrow New \rightarrow search molecules 和 Do not search atoms… \rightarrow Max.length=3 \rightarrow OK
  • 取消勾选 Volumetic date 下的 Show sections.
  1. File \rightarrow Export Raster Image
  2. PS 处理。

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本文转载自博主 一个人就是一个叠加态  ,有部分删减修改,文中对相关概念方法做了详细的总结,留坑待填… 1. 第一原理计算的一些心得 1. 第一性原理 第一性原理其实是包括基于密度泛函的从头算和基于Hartree-Fock自洽计算的从头算,前者以电子密度作为基本变量(霍亨伯格-科洪定理),通过求解Kohn-Sham方程,迭代自洽得到体系的基态电子密度,然后求体系的基态性质;后者则通过自洽求解Hartree-Fock方程,获得体系的波函数,求基态性质 2. 交换关联泛函 DFT中密度泛函的Functional, 包括LDA,GGA,杂化泛函等等 一般LDA为局域密度近似,在空间某点用均匀电子气密度作为交换关联泛函的唯一变量,多数为参数化的CA-PZ方案; GGA为广义梯度近似,不仅将电子密度作为交换关联泛函的变量,也考虑了密度的梯度为变量,包括PBE,PW,RPBE等方案,BLYP泛函也属于GGA; 还有一些杂化泛函,B3LYP等 3. 赝势 在处理计算体系中原子的电子态时,有两种方法,一种是考虑所有电子,叫做全电子法,比如WIEN2K中的FLAPW方法(线性缀加平面波);此外还有一种方法是只考虑价电子,而把芯电子和原子核构成离子实放在一起考虑,即赝势法,一般赝势法是选取一个截断半径,截断半径以内,波函数变化较平滑,和真实的不同,截断半径以外则和真实情况相同,而且赝势法得到的能量本征值和全电子法应该相同。 赝势包括模守恒和超软,模守恒较硬,一般需要较大的截断能,超软势则可以用较小的截断能即可。另外,模守恒势的散射特性和全电子相同,因此一般红外,拉曼等光谱的计算需要用模守恒势。 赝势的测试标准应是赝势与全电子法计算结果的匹配度 ,而不是赝势与实验结果的匹配度,因为和实验结果的匹配可能是偶然的。 4. 收敛测试 Ecut,也就是截断能,一般情况下,总能相对于不同Ecut做计算,当Ecut增大时总能变化不明显了即可;然而,在需要考虑体系应力时,还需对应力进行收敛测试,而且应力相对于Ecut的收敛要比总能更为苛刻,也就是某个截断能下总能已经收敛了,但应力未必收敛。 K-point,即K网格,一般金属需要较大的K网格,采用超晶胞时可以选用相对较小的K网格,但实际上还是要经过测试。 5. 磁性 一般何时考虑自旋

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